MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020054	TCG	2	6	310399	310404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6002	NC_020054	AGGC	2	8	310419	310426	25 %	0 %	50 %	25 %	436833620
6003	NC_020054	GAT	2	6	310533	310538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833620
6004	NC_020054	GT	3	6	310574	310579	0 %	50 %	50 %	0 %	436833620
6005	NC_020054	AGC	2	6	310690	310695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6006	NC_020054	GCA	2	6	310763	310768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6007	NC_020054	TGA	4	12	310775	310786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833620
6008	NC_020054	AGCTT	2	10	310838	310847	20 %	40 %	20 %	20 %	436833620
6009	NC_020054	TTG	2	6	310855	310860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833620
6010	NC_020054	CAT	2	6	310866	310871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833620
6011	NC_020054	CAC	2	6	310923	310928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833620
6012	NC_020054	GAT	3	9	310938	310946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833620
6013	NC_020054	AGC	2	6	311020	311025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6014	NC_020054	GTG	2	6	311056	311061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833620
6015	NC_020054	CAG	3	9	311079	311087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6016	NC_020054	GTG	2	6	311158	311163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833620
6017	NC_020054	TCG	2	6	311218	311223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6018	NC_020054	TCT	2	6	311225	311230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833620
6019	NC_020054	CAC	2	6	311277	311282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833620
6020	NC_020054	CGT	2	6	311297	311302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6021	NC_020054	TTG	2	6	311308	311313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833620
6022	NC_020054	CACGT	2	10	311361	311370	20 %	20 %	20 %	40 %	436833620
6023	NC_020054	GAT	2	6	311400	311405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833620
6024	NC_020054	CAC	2	6	311451	311456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833620
6025	NC_020054	C	6	6	311488	311493	0 %	0 %	0 %	100 %	436833620
6026	NC_020054	CAT	2	6	311519	311524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833620
6027	NC_020054	CGT	2	6	311535	311540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6028	NC_020054	TAGC	2	8	311552	311559	25 %	25 %	25 %	25 %	436833620
6029	NC_020054	CCG	2	6	311599	311604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833620
6030	NC_020054	CAC	2	6	311610	311615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833620
6031	NC_020054	TGGA	2	8	311665	311672	25 %	25 %	50 %	0 %	436833620
6032	NC_020054	CGG	2	6	311742	311747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833620
6033	NC_020054	TCG	2	6	311836	311841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6034	NC_020054	ACCG	2	8	311878	311885	25 %	0 %	25 %	50 %	436833620
6035	NC_020054	CGT	2	6	311889	311894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833620
6036	NC_020054	CCT	2	6	311951	311956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833620
6037	NC_020054	CGGCC	2	10	311965	311974	0 %	0 %	40 %	60 %	436833620
6038	NC_020054	TGGTGT	2	12	311990	312001	0 %	50 %	50 %	0 %	436833620
6039	NC_020054	CAC	2	6	312045	312050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833620
6040	NC_020054	GCC	2	6	312051	312056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833620
6041	NC_020054	GAA	2	6	312078	312083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833620
6042	NC_020054	TGA	2	6	312113	312118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833620
6043	NC_020054	AGC	2	6	312265	312270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6044	NC_020054	CTTC	2	8	312274	312281	0 %	50 %	0 %	50 %	436833621
6045	NC_020054	ACG	2	6	312286	312291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6046	NC_020054	GTA	2	6	312402	312407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833621
6047	NC_020054	ACG	2	6	312424	312429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
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6049	NC_020054	TTG	2	6	312490	312495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833621
6050	NC_020054	TGG	2	6	312512	312517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833621
6051	NC_020054	AGC	2	6	312535	312540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6052	NC_020054	TGT	2	6	312548	312553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833621
6053	NC_020054	TGC	2	6	312599	312604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6054	NC_020054	CTG	2	6	312675	312680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6055	NC_020054	GC	3	6	312769	312774	0 %	0 %	50 %	50 %	436833621
6056	NC_020054	CGA	2	6	312803	312808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6057	NC_020054	GCA	2	6	312881	312886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
6058	NC_020054	GTT	2	6	312927	312932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833621
6059	NC_020054	GTT	2	6	313041	313046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833621
6060	NC_020054	T	6	6	313096	313101	0 %	100 %	0 %	0 %	436833621
6061	NC_020054	ACG	2	6	313165	313170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
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6063	NC_020054	CAGC	2	8	313319	313326	25 %	0 %	25 %	50 %	436833621
6064	NC_020054	AGC	3	9	313324	313332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833621
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6067	NC_020054	AAG	2	6	313450	313455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833622
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6069	NC_020054	CAC	2	6	313710	313715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833622
6070	NC_020054	CTG	2	6	313719	313724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833622
6071	NC_020054	CGCC	2	8	313733	313740	0 %	0 %	25 %	75 %	436833622
6072	NC_020054	CGG	2	6	313763	313768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833622
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6074	NC_020054	CGC	2	6	313812	313817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833622
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6080	NC_020054	GCT	2	6	314219	314224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833622
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6085	NC_020054	TTGGG	2	10	314534	314543	0 %	40 %	60 %	0 %	436833622
6086	NC_020054	TGGTG	2	10	314676	314685	0 %	40 %	60 %	0 %	436833622
6087	NC_020054	GGCCA	2	10	314718	314727	20 %	0 %	40 %	40 %	436833622
6088	NC_020054	AAC	2	6	314749	314754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833622
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6091	NC_020054	CTTT	2	8	315066	315073	0 %	75 %	0 %	25 %	436833623
6092	NC_020054	ACA	3	9	315094	315102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833623
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6094	NC_020054	GCGG	3	12	315309	315320	0 %	0 %	75 %	25 %	436833623
6095	NC_020054	ACG	2	6	315352	315357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833623
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6099	NC_020054	ACA	2	6	315592	315597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833623
6100	NC_020054	TGA	2	6	315643	315648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833623
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6102	NC_020054	G	7	7	315803	315809	0 %	0 %	100 %	0 %	436833623
6103	NC_020054	CTG	2	6	315840	315845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833623
6104	NC_020054	GCT	2	6	315866	315871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833623
6105	NC_020054	GCT	2	6	315923	315928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833623
6106	NC_020054	GACC	2	8	315948	315955	25 %	0 %	25 %	50 %	436833623
6107	NC_020054	TA	3	6	315962	315967	50 %	50 %	0 %	0 %	436833623
6108	NC_020054	AGC	2	6	316015	316020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833623
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6110	NC_020054	GTC	2	6	316179	316184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833623
6111	NC_020054	GGC	2	6	316224	316229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833623
6112	NC_020054	CCG	2	6	316330	316335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833623
6113	NC_020054	T	7	7	316434	316440	0 %	100 %	0 %	0 %	436833624
6114	NC_020054	CG	3	6	316456	316461	0 %	0 %	50 %	50 %	436833624
6115	NC_020054	GCC	2	6	316497	316502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833624
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6118	NC_020054	CAG	2	6	316607	316612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833624
6119	NC_020054	TAA	2	6	316682	316687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436833624
6120	NC_020054	GCG	2	6	316745	316750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833624
6121	NC_020054	GAT	2	6	316799	316804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833624
6122	NC_020054	GGCCAG	2	12	316808	316819	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	436833624
6123	NC_020054	CAG	2	6	316847	316852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833624
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6131	NC_020054	TCG	2	6	317067	317072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833624
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6142	NC_020054	TGA	2	6	317452	317457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833624
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6144	NC_020054	GCG	2	6	317548	317553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833624
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6229	NC_020054	GGT	2	6	322698	322703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833630
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6231	NC_020054	CAT	2	6	322755	322760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833630
6232	NC_020054	CGGG	2	8	322795	322802	0 %	0 %	75 %	25 %	436833630
6233	NC_020054	ATCGT	2	10	322828	322837	20 %	40 %	20 %	20 %	436833630
6234	NC_020054	CGG	2	6	322906	322911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833630
6235	NC_020054	CAG	2	6	323053	323058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833630
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6237	NC_020054	ACG	2	6	323174	323179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833630
6238	NC_020054	ATC	2	6	323194	323199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833630
6239	NC_020054	CGG	2	6	323237	323242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833630
6240	NC_020054	GGC	2	6	323290	323295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833630
6241	NC_020054	TCA	2	6	323300	323305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833630
6242	NC_020054	CAA	2	6	323343	323348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833630
6243	NC_020054	GCT	2	6	323400	323405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833630
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6245	NC_020054	CTG	2	6	323428	323433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833630
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6267	NC_020054	CG	3	6	324767	324772	0 %	0 %	50 %	50 %	436833631
6268	NC_020054	TCA	2	6	324773	324778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833631
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6270	NC_020054	ATGA	2	8	324878	324885	50 %	25 %	25 %	0 %	436833632
6271	NC_020054	CAAT	2	8	324886	324893	50 %	25 %	0 %	25 %	436833632
6272	NC_020054	GGA	3	9	324968	324976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833633
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6348	NC_020054	GGATT	2	10	328375	328384	20 %	40 %	40 %	0 %	436833636
6349	NC_020054	ACG	2	6	328424	328429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833636
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6353	NC_020054	GCT	2	6	328684	328689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833636
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6355	NC_020054	GCTG	2	8	328729	328736	0 %	25 %	50 %	25 %	436833636
6356	NC_020054	GAT	2	6	328756	328761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833636
6357	NC_020054	TCG	2	6	328787	328792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833636
6358	NC_020054	GCA	2	6	328813	328818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833636
6359	NC_020054	CCA	2	6	328836	328841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833636
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6361	NC_020054	TTCG	2	8	328983	328990	0 %	50 %	25 %	25 %	436833636
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6481	NC_020054	CGT	2	6	334691	334696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833640
6482	NC_020054	CAG	2	6	334836	334841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833640
6483	NC_020054	GCG	2	6	334945	334950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833640
6484	NC_020054	CGA	2	6	334983	334988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833640
6485	NC_020054	GCA	2	6	335000	335005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833640
6486	NC_020054	GGC	2	6	335056	335061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833640
6487	NC_020054	GAT	2	6	335070	335075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833640
6488	NC_020054	CGC	2	6	335088	335093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833640
6489	NC_020054	CTT	2	6	335108	335113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833640
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6491	NC_020054	TCT	2	6	335237	335242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833640
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